4Ion PI™ Template OT2 200 Kit v2 User Guide
Contents
Install the Ion Proton™ OT2 Oil . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Install the Ion PI™ OT2 Recovery Solution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Empty the waste container and inspect the oil waste tray . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
Prepare and install the amplification solution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Materials required for this procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Prepare the amplification solution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Fill the Ion
PI™ Plus Reaction Filter Assembly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Install the filled Ion PI™ Plus Reaction Filter Assembly on the
Ion OneTouch™ 2 Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
Run the Ion OneTouch™ 2 Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Recover the template-positive Ion PI™ Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Materials required for this procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Recover the Ion PI™ Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Wash the template-positive Ion PI™ Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Maintain the Ion OneTouch™ 2 Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Materials required for this procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
■CHAPTER 4 Enrich the template-positive Ion PI™
Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Materials required . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Perform the residual volume test on the Ion OneTouch™ ES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Prepare reagents then fill the 8-well strip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Prepare Melt-Off Solution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Wash and resuspend the Dynabeads® MyOne™ Streptavidin C1 Beads . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
Fill the 8-well strip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
Prepare the Ion OneTouch™ ES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
Perform the run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
Remove and wash the enriched Ion PI™ Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
(Optional) Perform the Ion Sphere™ Particles quality control . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
■APPENDIX A Quality control of Ion PI™
Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Ion Sphere™ Quality Control assay . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Quality control using Qubit® 2.0 Fluorometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Equipment/supplies required . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Section 1: Upgrade the Qubit® 2.0 Fluorometer firmware and software . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Section 2: Calculate the Qubit® 2.0 Fluorometer calibration factor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
Section 3: Measure the unenriched, templated Ion PI™ Ion Sphere™ Particles . . . . . . . . . . . . 80
Ion Sphere™ Quality Control assay troubleshooting table . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85